A la derecha del altar mayor, en el crucero vemos un imponente retablo de madera, en forma de templete donde se venera la imagen del Nazareno, imagen esculpida en 1942 por Rafael Alemany Camps. Este altar fue construido en 1750 según diseño de fray José Alberto Pina. La idea inicial fue para el altar mayor de la Colegiata. Se levanta sobre un gran banco de mármoles de planta dinámica en la que juegan las líneas cóncavas y convexas; al dorarlo y decorarlo en 1923 se le supo dar mayor hermosura y brillantez; la parte superior, de madera, fue destruida en 1938 y posteriormente reconstruida con toda fidelidad gracias a fotografías del anterior retablo. Esta obra la realizó Francisco Garcés Martínez hacia 1961. La parte superior del retablo es una especie de aplauso reverencial, ángeles adorando, cubren el punto central del retablo: la figura de Jesús, el Redentor del hombre, cargado con su cruz, él es la imagen principal y hacia él deben dirigirse los ojos y el corazón y también la plegaria.

Una imagen singular y en la cual apenas nadie se fija es el Niño Jesús Nazareno. En el crucero, junto al altar del Nazareno; en un pequeño templete de madera resalta la imagen, preciosa y nada común: Jesús niño, vestido de nazareno, coronado de espinas y con una cruz en las manos; es como un adelanto a la Pasión que sufrirá el Jesús adulto. La imagen es original de Esteve Bonet, y en 1962 fue donada a la Seo por la familia De Diego.